En 2001, Adams, développeur d'UseModWiki et contributeur à Wikipédia , a apporté de nombreuses améliorations à l'utilisation de l'encyclopédie dans les versions 0.91 et 0.92, notamment les « liens libres » qui utilisent des doubles crochets (par exemple, [[Wikipedia]]) pour créer un lien vers une autre page, complétant ainsi l'ancienne fonctionnalité d'utilisation de la notation camelCase . En septembre 2003, après deux ans de développement depuis la version précédente, la version 1.0 a introduit de nombreuses nouvelles fonctionnalités, dont CSS , RSS , le téléchargement de fichiers et l'UTF-8 .
Le développement fut alors interrompu et une vulnérabilité de type cross-site scripting (CVE-2004-1397) fut découverte en décembre 2004. Elle fut corrigée en juillet 2007 lorsque Markus Lude reprit le projet UseModWiki à Clifford Adams, avec la publication de la version 1.0.1. Seules des versions correctives ont été publiées depuis. Le domaine officiel a été transféré vers usemod.org fin septembre 2023, et une mise à jour mineure prenant en compte ce changement a été publiée en novembre.
Utilisation par Wikipédia
Le logiciel wiki de Wikipédia en anglais était UseModWiki (phase I, rétroactivement) depuis sa création le 15 janvier 2001, et dès janvier 2002, les Wikipédias en 22 langues utilisaient UseModWiki. L'édition anglaise est passée au « script PHP » (phase II) le 25 janvier 2002, un nouveau logiciel wiki basé sur UseModWiki mais réécrit en PHP . Le 20 juillet, le « script PHP » a ensuite été remplacé par son propre logiciel wiki réécrit (phase III), actuellement connu sous le nom de MediaWiki , pour de meilleures performances et fonctionnalités.
Les autres éditions linguistiques sont progressivement passées à MediaWiki par la suite, et fin 2003, seules quelques éditions actives, dont Wikipédia en catalan, utilisaient encore UseModWiki. En 2004, les dernières éditions UseModWiki sont passées à MediaWiki.